從事受控交易之營利事業於辦理所得稅結算申報時，應備妥下列證明關係人交易所得額為正 確所得額之相關文據，並於稽徵機關進行調查 時，依規定提示：
(一)企業綜覽。 (二)組織結構。 (三)受控交易之彙整資料。 (四)移轉訂價報告（自 94 年度營利事業所得稅 結算申報案件開始適用），至少需包括下列內容：

1. 產業及經濟情況分析。
2. 受控交易各參與人之功能及風險分析。
3. 依常規交易原則辦理之情形。
4. 選定之可比較對象。
5. 可比較程度分析。
6. 選定之最適常規交易方法及選定之理由、列入考量之其他方法及不予採用之理由。
7. 其他參與人採用之訂價方法。
8. 依最適常規交易方法決定常規交易結果之情形。
9. 受控交易之結果是否符合常規。
10. 按常規交易結果調整之情形。

依移轉訂價查核準則第 22 條第 3 項規定，受
控交易金額在財政部規定標準以下者，得以其 他足資證明其訂價結果符合常規交易結果之 文據取代移轉訂價報告。財政部於 94 年 12 月30 日以台財稅字第 09404587590 號令訂定「得 以其他文據取代移轉訂價報告之受控交易金 額標準」，從事受控交易之營利事業，有下列情形之一者，得以其他文據取代移轉訂價報告：
(一)全年營業收入淨額及非營業收入合計數(以 下簡稱收入總額)未達新臺幣 1 億元。 (二)全年收入總額在新臺幣 1 億元以上，但未達新臺幣 3 億元，且同時符合下列規定者：

1. 未享有租稅減免優惠，且未依法申報扣除 前 5 年虧損。但營利事業依法申報實際抵 減當年度營利事業所得稅結算申報應納稅額及前 1 年度未分配盈餘申報應加徵稅額之金額合計在新臺幣 1 百萬元以下，或依 法實際申報扣除之前 5 年虧損金額在新臺 幣 4 百萬元以下者，不在此限。
2. 金融控股公司或企業併購法規定之公司或 其子公司，未有中華民國境外之關係人(包 括總機構及分支機構)；其他營利事業，未 有中華民國境外之關係企業(包括總機構 及分支機構)。
   

(一)申請人應提出執行預先訂價協議之年度報告：

1. 申請人應於適用預先訂價協議之各課稅年 度結算申報期間內提出。年度報告之內容，包括實際訂價及各參與人之損益情形、依預 先訂價協議辦理之情形、影響交易結果之假
   設條件及因素之變動情形等。
2. 簽署日期前已辦理所得稅結算申報之年 度，應於稽徵機關規定期間內，提出預先訂價協議條款對其結算申報內容之影響報 告，無需再提年度報告。

(二)影響交易結果之因素發生顯著變化時：

1. 申請人應於變化之日起 1 個月內通知該管稽徵機關。
2. 稽徵機關應與營利事業協商修改預先訂價協議條款及條件，或停止預先訂價協議之適用。
   

(一)營利事業已依移轉訂價查核準則第 22 條規 定提示文據者：稽徵機關應依該準則規定核 定受控交易之結果，並據以核定相關納稅義 務人之所得額。
(二)營利事業未依上述準則規定提示文據者：

1. 稽徵機關得依查得資料，按前述規定核定。
2. 其無查得之資料且營利事業未提示之文據 係關係其所得額計算之「成本」或「費用」 者，稽徵機關得就該部分相關之「營業收入
   淨額」依同業利潤標準核定。

營利事業未依移轉訂價查核準則規定決定申報受控交易之常規交易結果，致減少我國納稅義務，經稽徵機關依該準則規定調整並核定所得額者，如有下列具體短漏報情事之一，應依所得稅法第 110 條規定處罰：
(一)營利事業申報受控交易之價格與稽徵機關核定之常規交易價格有下列顯著差異者：

1. 受控交易之價格影響營利事業之成本、費用或損失者，其申報之價格在核定之常規交易價格 2 倍以上。
2. 受控交易之價格影響營利事業之收入者，其申報之價格在核定之常規交易價格 50%以下。
   

(二)受控交易經稽徵機關調整並核定增加之所得額，達營利事業核定全年所得額 10%以上，且達其核定全年營業收入淨額 3%以上。
(三)營利事業未提示移轉訂價報告，且無法提示其他文據證明其訂價結果符合常規交易結果。
(四)其他經稽徵機關查得有具體短漏報事證且短漏報金額鉅大者。